Podle Světové zdravotnické organizace jsou bakterie salmonely jednou z nejčastějších příčin potravinových onemocnění na celém světě. Ve Spojených státech způsobuje 1,4 miliony infekcí více než 150 000 návštěv lékařů, 15 000 hospitalizací a 500 úmrtí každý rok. Ačkoli otrava salmonelou obvykle způsobuje mírnou, samo-omezenou gastroenteritidu ("salmonelózu"), v některých případech může dojít k dlouhodobým účinkům.
Metastatické infekce
Ve vzácných případech uniká salmonel ze střeva, aby vstoupil do krevního oběhu. Infekce krevního oběhu může být sama o sobě fatální a může způsobit dlouhodobé komplikace, když se salmonely šíří (metastazují) z krevního řečiště, aby infikovaly jiné oblasti těla. Mezi příklady metastatických infekcí salmonel patří infekce srdečních chlopní a výstelky srdce (endokarditida), kost (osteomyelitida), ledviny (pyelonefritida) a další měkké tkáně včetně mozku. Obvykle se tyto infekce pomalu rozvíjejí a trvají mnohem déle než 12 až 72 hodin spojených s klasickou salmonelovou gastroenteritidou. Vznikají zřídka u zdravých dospělých a jsou mnohem častější u lidí s narušeným imunitním systémem (jako jsou pacienti s AIDS, rakovina, srpkovitá anémie) nebo více zdravotních problémů.
Autoimunitní onemocnění
Po expozici salmonelou vytváří imunitní systém protilátky proti bakteriím. Bakterie salmonely bohužel připomínají značku povrchu buněk přítomnou u mnoha lidí. Výsledkem je autoimunitní onemocnění způsobující Reiterův syndrom, který způsobuje chronickou kloubní bolest (artritidu), podráždění oka (konjunktivitidu s iritidou nebo bez ní) a problémy s močením (uretritida). Ve studii z roku 2001 v časopise Clinics on Infectious Disease téměř jedna třetina lidí, kteří byli infikováni Salmonella Dnteridis, jedním z nejčastějších druhů salmonel, vyvinula artritidu, která trvala až 6 měsíců a téměř 50% hlásilo recidivu po vyřešení počáteční epizody.
Chronické nosiče
V některých případech se lidé uzdraví od infekce salmonelou, aby se stali chronickými nosiči. Nejslavnějším příkladem lidského chronického nosiče salmonel je "břečťanka Panna". J.W. Leavittova kniha z roku 1996 "Týdenní Mary: V zajetí veřejného zdraví" popisuje pravdivý příběh asymptomatického irského a amerického kuchaře spojeného s 54 případy a čtyřmi úmrtí v devíti různých epidemiech břišních tyfií na počátku 20. století v New Yorku.
V současné době mohou být chronické nosné stavy obvykle eradikovány rozšířeným průběhem antibiotik, i když jednotlivci mohou podléhat omezením typu práce, kterou mohou provést v mezidobí. Většina chronických nosičů je asymptomatická. Pacienti s AIDS a jinými typy imunitních kompromisů však mohou trpět opakujícími se recidivami dříve, než budou antibiotika účinná.
